La Cittadella e' la Sala Controllo dell'Arca, dove si possono attivare gli Halo senza l'Indice, e senza subire l'azione degli anelli stessi.
Essa è una struttura colossale, situata in un canyon nevoso, e protetta da una barriera retraibile; all'interno vi è un corridoio lungo, in cui sono proiettati gli ologrammi dei 7 Halo.
In questo edificio, nella campagna di Halo 3, è possibile trovare uno dei 13 teschi, IWHBYD, saltando dentro agli anelli secondo una sequenza stabilita. Inoltre, sempre nel Videogame, si potrà usufruire di una breve alleanza coi Flood, giunti sull'arca grazie alla città Alta Opera.